La protection temporelle de l’Ordre est assumée par S.A.R. le Comte de Paris, Duc de France depuis la 12 septembre 2004.

Cette protection fait partie des prérogatives du chef de la Maison Royale de France depuis la décision du roi Philippe le Bel en 1308. Les prérogatives du Chef de la Maison Royale de France concernant la protection des Ordres sont celles reconnues selon l’usage des autres cours européennes. Lettre de Monseigneur le Comte de Paris : « En ce huit Décembre 2004, Fête de l'Immaculée Conception, Je confère à mon neveu, SAR le Prince Charles Philippe d'Orléans, Grand Maître de l’Ordre Militaire et Hospitalier de Saint-Lazare de Jérusalem, le titre de Duc d'Anjou, avec le blason qui lui est propre… …Concernant l’Ordre de Saint-Lazare de Jérusalem, je tiens à lui remémorer qu’en juillet 1308, le roi Philippe le Bel déclara « prendre sous sa garde spéciale, et sous sa protection, le Maître Général, et les frères de l’Ordre de Saint-Lazare de Jérusalem » afin de leur éviter toute spoliation. Considérant par ailleurs les origines et légitimations canoniques de 1255 par le Pape Alexandre IV, et celle de 1772 par le Pape Clément XIV, et me référant au protectorat exercé par les différents rois de France depuis 1516 jusqu'en 1830... II m'apparaît maintenant évident d'assumer en tant que Chef de la Maison Royale de France cet héritage, et de perpétuer la tradition de protection de cette vénérable Institution, l’Ordre Militaire et Hospitalier de Saint-Lazare de Jérusalem… ».